Das Längsschiff der alten Kirche wurde 1979 abgerissen, da es durch den wachsenden Kurbetrieb zu klein geworden war. Erhalten blieb der charakteristische Zwiebelturm mit drei kunstgeschichtlich bedeutenden Glocken aus dem 17. und 18. Jahrhundert.
Baulicher Mittelpunkt der Gemeinde Schluchsee ist die Pfarrkirche St. Nikolaus. Sie wurde ursprünglich zwischen 1253 und 1275 erbaut und besteht in ihrer heutigen Form seit 1980. Das ehemalige, zu klein gewordene Längsschiff mit Apsis im Osten und Turm im Westen wurde 1979 abgerissen und durch einen modernen Kirchenbau in Form eines Siebenecks ersetzt. Ergänzt wurde ein neues Kirchenschiff mit gewalmtem, fast bis zum Boden reichendem Schindeldach. Der unter Denkmalschutz stehende Zwiebelturm der alten Kirche blieb erhalten.
Sehenswert ist ein „Kinderreigen“, der die Außenseite des Portals schmückt. Die dargestellten Kinder drehen sich um Bischofsstab und Mitra – Sinnbilder des heiligen Nikolaus, des Patrons der Pfarrgemeinde.
Der Zelebrationsaltar enthält Elemente des Altars der alten Kirche: Die Eckteile und die Platte des Altartisches wurden übernommen. Neu gestaltet wurden die Seitenelemente mit Trauben und Ähren, die an die Wandlung von Brot und Wein in der Eucharistie erinnern.
Der holzgeschnitzte Flügelaltar aus dem Jahr 1896 zeigt mehrere Heilige und biblische Szenen. Dargestellt sind von links nach rechts der heilige Blasius, der heilige Benedikt (da Schluchsee früher zum Benediktinerkloster St. Blasien gehörte), die Verkündigung des Engels an Maria, die Geburt Jesu, der heilige Konrad – Schutzpatron der Erzdiözese Freiburg – sowie der heilige Nikolaus als Patron der Kirche.
Die Kirchenfenster der alten Kirche wurden quer als Lichtband in den Neubau integriert. Das Dreifaltigkeitsfenster, früher in der Apsis hinter dem Hochaltar, ist heute neben dem Taufstein frei sichtbar.
Der Kreuzweg stammt vom Künstler Helmut Lutz aus Breisach. Die aus Lindenholz geschnitzten Stationen sind in Kugeln integriert. Das Kreuz aus Eisen dreht sich im Uhrzeigersinn, während die Kugeln symbolisch Schmerz und Tod darstellen.
Die Kirche St. Nikolaus ist barrierefrei.